Месец след като Google представи своя собствена система за плащания, започнаха първите оплаквания от нея. Според доста търговци и клиенти плащанията през новата система са много бавни и отнемат доста време. На доста от тях дори им се е наложило да прекратят транзакцията и да използват алтернативни методи за плащане. Проблемът е в мерките за сигурност, които Google използва, за да провери транзакцията. Освен стандартната проверка за валидност на кредитните карти от Google използват собствени алгоритми, включително и проверка на документите от представител на Google. Всички тези стъпки забавят процеса по плащането и следователно по получаването на дадения продукт или услуга.

Например Рис Лудлоу се опитал да плати през Google Checkout цифров фотоапарат, който купил за фирмата си от онлайн магазин. Той попълнил всички форми и необходими документи и очаквал до 1-2 дена да получи фотоапарата. След като минали 4 дена той се свързал с онлайн магазина, за да разбере защо се бави поръчката му. От там му отговорили, че все още не са получили парите, които явно се „обработват“ от Google и за това не са му пратили фотоапарата. Клиентът прекъснал транзакцията в Google Checkout и платил на компанията по алтернативен начин.

От Google не са публикували официално становище по въпроса, Във форума на Google Checkout един от администраторите е съобщил, че от компанията работят по проблема и скоро се очаква решение, което ще премахне всички забавяния. „Всички тези проверки са сложени заради сигурността на потребителите и техните пари. Нашето желание е парите да стигнат от купувача до търговеца без проблеми. Може би на моменти сме прекалено предпазливи в услугите си, но единствената ни цел е да предоставяме възможно най-добрата услуга“.